داستان سریال طوبی دربارهٔ زندگی دختری به نام طوبی و براساس واقعیت با اقتباس از کتاب (اربعین طوبی) است که ۴۰ سال دوره تاریخی از اوایل دهه ۱۳۵۰ تا ۱۳۹۰ را روایت می‌کند و یک قصه عاشقانه‌ای را در دل این تاریخ به تصویر می‌کشد، میانِ این روایت‌ها البته موضوع خانواده اهمیت بسزایی دارد و بخش پیاده‌روی اربعین آن بخش مهم داستان به‌شمار می‌رود